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医学图书馆文献资源与北京大学各附属医院图书馆文献资源协调配套，共同形成全校医、教、研工作所需的医药卫生文献保障系统。图书馆特藏有珍、善本古代图书，其中有中国大陆唯一珍善本——手抄本《太平圣惠方》一部十函共100卷100册。
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